Parece que Tomás nació en Lincolnshire y que fue alumno del Colegio Corpus Christi de Oxford, donde se graduó en 1546. Llegó a ser rector de Stubton, pero renunció a su puesto cuando cambió la religión oficial bajo el reinado de la reina Isabel. Su siguiente cargo, como maestro de una escuela en Lincoln, también tuvo que abandonarlo debido a su religión. Llegó a ser capellán de los insurgentes, en el levantamiento llamado «de los Dos Condes» (The Earls Rebellion o bien The Rising of the North), y en una antigua balada se le describe como «El Predicador de los Rebeldes». Celebró misa en la catedral de Durham el 4 de diciembre de 1569.
Cuando se vio que era imposible sostener el levantamiento y todo el norte estaba a merced de las tropas de la reina, Plumtree trató de escapar con otros, pero fue capturado y enviado de vuelta al castillo de Durham. Le fue señalado un castigo y después fue condenado a muerte. Su horca fue erigida en el mercado y al llegar allí, le ofrecieron su vida a cambio de la apostasía, pero respondió que «no tenía deseos de continuar viviendo en este mundo, a cambio de morir para Dios». Murió valerosamente el 4 de enero, y fue sepultado diez días después. Su fiesta se celebra em algunos sitios el 4 de febrero.
Véase, Camm, Lives of English Martyrs, vol. II, pp. 111-186.