Stefan Wyszynski nació en Zuzela (Polonia) el 3 de agosto de 1901, en el seno de una familia pobre y muy religiosa. En 1920 ingresó en el seminario diocesano de Wloclawek. Ordenado sacerdote el 3 de agosto de 1924, fue nombrado vicario en la Basílica Catedral. De 1925 a 1929 estudió derecho canónico y ciencias socioeconómicas en la Universidad Católica de Lublin, obteniendo un doctorado en derecho canónico. De 1930 a 1939 ocupó los cargos de vicario parroquial, redactor jefe de la revista Ateneum Kaplanskie, profesor de Ciencias Sociales en el seminario diocesano, director de las Obras Misioneras Diocesanas, Defensor del vínculo, Promotor de justicia en la Corte Episcopal, Director del "Sodalicio mariana" y de la Universidad Cristiana de los Trabajadores.
Cuando Polonia fue invadida por las tropas alemanas en 1939, muchos sacerdotes fueron internados en campos de concentración y asesinados. El obispo de Wloclawek, Monseñor Michele Kozal, también fue detenido y posteriormente deportado a Alemania donde, tras ser torturado, fue asesinado. Durante este período, el beato llevó a cabo su apostolado en la clandestinidad. Habiendo llegado a ser capellán del Ejército Nacional, trató de satisfacer las necesidades no solo de los soldados sino también de los civiles.
En 1942, junto con la Sra. Maria Okonska, fundó el Instituto Secular de Auxiliares de María de Jasna Góra, Madre de la Iglesia. Después de la guerra, el beato volvió a Wloclawek y, debido a la falta de sacerdotes, tuvo que asumir varios cargos al mismo tiempo: Rector del Seminario, Párroco en dos parroquias, Redactor del Semanario Diocesano, del Boletín Diocesano y de la Revista para el clero.
El 4 de marzo de 1946, Pío XII lo nombró obispo de Lublin. A esta diócesis, devastada por el conflicto, le dio un nuevo impulso pastoral al interesarse por todos los sectores pastorales, incluida la Universidad Católica, de la que fue Gran Canciller. El 12 de noviembre de 1948 fue trasladado a la archidiócesis de Gniezno y Varsovia, sede primada de Polonia. Mientras tanto, los nazis habían sido reemplazados por los comunistas. Había una comisión conjunta gobierno-iglesia para negociar algunas iniciativas importantes que eran desfavorables para el desarrollo de la fe. El acuerdo, firmado en 1950, pareció a muchos una derrota de la Iglesia. En realidad, era la única manera de que la Iglesia sobreviviera en Polonia. El 29 de noviembre de 1952 se anuncia el nombramiento cardenalicio del beato, pero el 12 de enero no obtiene pasaporte del gobierno para viajar a Roma y participar en el Consistorio.
El 8 de mayo de 1953, en nombre del Episcopado, el beato dirige a las autoridades estatales un mensaje conocido como "Non possumus" en el que afirma la voluntad de no ceder más y de no sacrificar "las cosas de Dios sobre los altares de César". El 24 de septiembre de 1953 fue arrestado y encerrado en régimen de aislamiento. Fue puesto en libertad el 28 de octubre de 1956 y reanudó sus actividades pastorales, convirtiéndose en un símbolo de libertad, justicia, respeto por la humanidad y la unidad de todos los polacos.
El cardenal Wyszynski participó activamente en el Concilio Vaticano II, en particular en la redacción de la Declaración sobre la libertad religiosa "Nostra aetate". Se comprometió con la reconciliación cristiana entre las naciones polaca y alemana. De 1970 a 1981 instó a la Conferencia Episcopal Polaca a interesarse más por los cambios que se estaban produciendo en la sociedad. Mientras tanto, en marzo de 1981, el tumor que lo había golpeado empeoró. Sin embargo, el 22 de mayo el Siervo de Dios participó por última vez en la sesión de la Conferencia Episcopal Polaca, donde pronunció un largo discurso.
Murió el 28 de mayo de 1981 en Varsovia (Polonia).